影片聚焦“无声末世”第一天，人类尚未掌握“出声即死”的法则，在怪物面前不堪一击。数以千计的怪物从天而降，怪物数量达到系列之最，视角也从前作的乡村小镇升级到美国第一大都市——纽约，全球沦陷，人类生活的街道、地铁、超市等地都变得危机四伏，一旦出声便会被潜藏的怪物“贴脸开大”，喧嚣的纽约沦陷为一座沉默的孤城，苟活的人类在此上演一场极限大逃亡。
即将成年的叛逆女孩果儿，一次意外的异能展现救助了窃贼小秦，没想到却惹来了杀身之祸，养母安娜为保护果儿所牺牲。悲痛欲绝的果儿通过养父嘉穆了解到自己的身世之谜。果儿为女娲之子，拥有预示之能，身体中的血液与族人寻找的圣物有关。在三人逃亡与躲避追杀中知晓果儿的身份与大祭司所要寻找的圣物关联甚密。大祭派手下安烈将果儿抓获，祭司告知果儿圣物秘密，鬼族惨遭灭亡都是果儿祖父鬼王一人所为，大祭司深受其害。果儿瞬间变得匪夷所思，这与嘉穆所说完全相反。次日通过小秦的援救，几人逃脱逃出地牢。为了解开心中疑惑，嘉穆带大家来到了一个神秘的地方，找到了安娜的孪生妹妹肖夫人，肖夫人告知果儿是开启圣物的钥匙。看似谜团似乎被揭开之时，却不知这一切都是鬼王的计谋，世界即将毁灭。
元都市突降特大暴雨。风雨中，一位六十五岁的阿姨拉着买菜小车，步履艰难却异常坚定，她循着快递地址找到女儿的合租屋，未经允许便动手将这间乱如垃圾堆的屋子彻底清扫。大扫除时，她与冰箱深处一块顽固积冰狭路相逢，一番较劲后硬生生凿下厚冰。出于节俭，她将冰块融化烧开，用热水泡脚，因太过舒适，她不知不觉昏睡过去。等她在黑暗中醒来时，她已不再是她，而是一只令人毛骨悚然的巨型怪虫。
距今50多年前，一艘来自赛博坦的飞船坠落月球，由此引发了美苏两国的太空竞赛。人类争相登上月球，只为一探飞船残骸中的秘密。时间回到21世纪初，经过几番征战，汽车人终于挫败霸天虎的入侵，继而与人类合作，共同保卫美丽的地球。然而发生在切尔诺贝利的事件却将尘封已久的月球计划重新摆到桌面。为了防止霸天虎找到能量柱为非作歹，擎天柱与战友飞赴月球，更从当年的飞船中救出了汽车人的先代领导者——御天敌。御天敌是能量柱的发明者，将上百根能量柱集合在一起便可制造太空桥，实现物质的瞬间传送。 忙着找工作以及和女友卡莉（罗茜·汉丁顿-惠特莉Rosie Huntington-Whiteley 饰）经营爱情的山姆（希亚·拉博夫 Shia LaBeouf 饰）无可避免地卷入其中，他渐渐发现霸天虎的操纵一切的阴谋，却不知更大的阴谋和危机隐藏在那月影背后……
