该剧主要讲述了环境资源法官罗远、法庭顾问夏未冬等一批锐意有为的司法工作者在一连串环保案件中扫黑除恶明法、打击污染犯罪、维护环境生态、探索司法改革、捍卫公众权益的故事。作为中国首部环保司法题材剧，剧集聚焦长江流域环境保护司法实践的精彩案例，讲述环境资源审判的“中国故事”。影片编创团队希望用这样一部故事背景源自生活、视角兼顾官方和民间的现实主义大剧，来吸引社会各界的关注，借此展示环保司法改革之路的艰辛，推广绿色发展理念，增强民众环保意识。
故事发生在抗战时期的上海。中共特工“杜鹃”中村功（陈宝国 饰）在好友掩护下，从“佐尔格”谍案中脱身，出任上海特别行动处主任。负责与他单线联系的老郭被“白鸽”出卖，最终在牢中自杀。特务组织机关长影佐祯昭（徐成峰 饰）怀疑中村功的身份，又苦于证据不足，便把特高课长石川云子（田中千绘 饰）安排在中村功的卧榻旁边，以期获取证据。由于情报失误，新四军情报部门派情报科长董剑飞（丁志诚 饰）赴上海刺杀中村功。中村功深知董剑飞共党身份，他与其巧妙地周旋着。期间，中村功动用他广泛的人脉搜集了日军大量情报，特别是日军将南下作战的方案布署。但怎么将情报送出去成了摆在他心头的难题，他决定孤注一掷......
在传说中的九城，名门穷小姐范云和白切黑城主齐峥从彼此试探到相互信任，二人一路披荆斩棘为民谋利，最终收获友谊与爱情；范云也助齐峥平天下破陈规，解决九城危机，携手为民打造繁荣九城。
1988年，刑警卫国平（张译 饰）在追捕连环谜案的行动中目睹战友牺牲，而凶手却逃跑了，此事成为卫国平的心结。八年后，宁江市发生了骇人听闻的凶杀案，此时卫国平已成长为成熟的刑警队长。他在带领队员调查的过程中相继破获了不少相关案件，但是凶杀案始终充满疑云，并且很多线索与八年前的连环谜案有关，这些发现让卫国平振奋但也成为他后来判断案情的阻碍。在案件的推进过程中，一个庞大的犯罪集团逐渐浮出水面……
一个是身家过亿的女总裁，一个是身无分文的无业游民，慕晚晴和刘青的第一次见面就在两个人的婚礼现场。从毫无感情、互相敌对，到彼此扶持、互生情愫，刘青一边暗中帮助慕晚晴解决公司遇到的重重危机，一边机智对抗着横空出现的慕晚晴前任男友冯聪。就在两人的感情经历重重考验之际，一股背后的黑暗势力也渐渐浮出水面。为了完成老一辈的遗愿，慕晚晴和刘青踏上了去泰国的行程，与黑暗势力正面交锋并取得了胜利，二人也认定对方是自己的所爱。两人回国过上幸福圆满的生活。
20世纪80年代，结束了黑暗的十年动乱，饱经磨难的新中国正进入改革开放的新时期。作为1953年以来首批大学毕业生的黎阳（陆毅 饰），出身背景底层平民家庭的他对未来出满期望，但是毫无背景的他注定在职场举步维艰。而一直喜欢他的女同学程真真（秦海璐 饰）动用老爸的力量帮黎阳调 动工作，也使得这个青年为了大好前途而抛弃了青梅竹马的女友曾小娅（沈佳妮 饰）。这对生活背景存在天壤之别的情侣，顶着负心人的骂名和各自家庭的巨大压力结为夫妇。短暂的蜜月期过后，彼此心底天然的落差让黎阳和真真的矛盾渐渐凸现。在此期间，黎阳的姐姐黎妮（吴越 饰）、黎山（郭京飞 饰）也各自经历着情感和人生道路上的波折。 波澜起伏的时代下，中国青年们的爱情缩影……
画心师岑欢因遭逢变故来到苍城，被中医铺子的宁为玉和司马空空救下。三人来到陆宅，结识了大小姐陆小曼与卫道人士九思，最终五人一起踏上了化人执念、解人心忧之途。在经历了一系列展现了人世间亲情、爱情、友情的故事后，他们终于感悟出：人生在世，遵守本心才是正途，邪魔外道终究会被正义打败。岑欢与宁为玉等人的感情日渐深重，他们也慢慢发现，自己所处的世界竟然只是一个梦境，而罪魁祸首，竟然就是妖兽转世的宁为玉和司马空空二人。最终，为了让世间的人醒来，不沉沦于梦境之中，他们选择牺牲了自己，唤醒了这个世界。
